生物質鍋爐運行之前，免不了要先完成加藥水處理環節，使得水質能達標。而這這過程實施起來很簡單，只要在生物質鍋爐的給水中加入適量的防垢劑就可以了，使其在鍋內與水中硬度物質發生化學反應，達到防止結垢的目的。
因為一旦防垢劑與水中的某些物質發生反應之后，就會生成疏松的、有流動性的水渣，并隨排污除去，從而防止生物質鍋爐結垢。這種處理方式不僅成本低、設備簡單，而且操作容易、管理方便等。
除了在防止結垢方面要運用防垢劑外，對于采用鈉離子交換處理的，殘留硬度較大或生物質鍋爐的鍋水pH值和堿度達不到標準要求時，也需進行鍋內加藥補充處理。
由此可見，防垢劑在生物質鍋爐中的作用不僅僅是防止結垢，還可以使得鍋水保持一定的堿度和pH值；并在在金屬表面形成保護膜，防止腐蝕；甚至可以促使硫酸鹽、硅酸鹽老垢疏松脫落。
目前在生物質鍋爐中常用的防垢劑有不少，包括純堿、磷酸鹽、復合防垢劑、有機磷酸鹽等等，每一種都有不同的優缺點和使用方式，分別適用在不同的工況下，幫助生物質鍋爐保持良好的狀態。
另外，還有關于防垢劑在生物質鍋爐中的具體用量，一般都是根據化驗結果確定的，加藥后應使鍋水的pH值和堿度都達到標準。以純堿為例，由于它在高溫下會水解產生部分氫氧化鈉，因此加藥量可根據給水的總硬度與總堿度之差決定。
