雖然很多行業領域都需要用到工業鍋爐，但其整個行業發展勢頭卻并不迅猛，其實這還是與工業鍋爐現存的一個問題有關。如果這些問題都能得到妥善解決的話，相信對于工業鍋爐行業來說將是一大突破。
一方面，有很多工業鍋爐的經濟運行水平并不高，比如說由于鍋爐容量選型過大的緣故，大多數的設備都將處于低負荷狀態運行；或者是鍋爐負荷波動大，導致它的調節能力有限，從而降低了它的實際運行效率。
另一方面，國內的工業鍋爐自控水平比較低，仍然以開環控制為主，導致其無法根據外界用能情況變化自動調節鍋爐運行狀態。也正是由于鍋爐的自動化水平低，使鍋爐的燃燒和運行調整變得難以操作和掌握，無法使鍋爐運行較快地適應工況的變動。
另外，因工業鍋爐配置的運行監測儀表不全或者失靈，又缺少必要的化驗手段，從而不能準確的測定蒸汽流量、燃煤量、過量空氣系數、爐渣含碳量、排煙溫度等經濟運行參數。工作人員在缺少數據的情況下，自然無法對鍋爐的運行狀況及時作出準確判斷。
還有一方面，工業鍋爐所用的燃料和爐型往往是不匹配的，才會造成著火困難，燃盡更困難等問題，難以保證鍋爐在設計狀態下運行。除此之外，環保設施不到位也是工業鍋爐的問題之一。
目前，我國10噸/時以下的燃煤工業鍋爐大多沒有配置有效的除塵裝置，而只是配套簡單的機械除塵器，由于受到除塵技術的限制，導致鍋爐的煙塵排放嚴重超標。
